Το 1990 η Άννα Συνοδινού πρωταγωνίστησε σε ένα ιστορικό επεισόδιο μέσα στην Βουλή κατά την διάρκεια της 3ης ψηφοφορίας για την εκλογή Προέδρου της Δημοκρατίας. Την επόμενη ημέρα υπέβαλλε την παραίτησή της από βουλευτής διαμαρτυρόμενη για το τρωθέν γόητρο του κοινοβουλίου.
Τα γεγονότα έγιναν ως εξής: Η βουλευτής των Οικολόγων Μαρίνα Δίζη σήκωσε ένα πανό το οποίο έγραφε: «Σταματήστε το θέατρο για το συν ένα, τον πρόεδρο και το νέφος». Την ίδια στιγμή, και ενώ ο πρόεδρος της Βουλής Αθανάσιος Τσαλδάρης προσπαθούσε να την ανακαλέσει στην τάξη, δεκάδες οπαδοί της φώναζαν από τα θεωρεία και έριχναν γαρύφαλλα στην Βουλή. Τότε έγιναν συλλήψεις και ακολούθησε ένας έντονος διάλογος ανάμεσα στην Άννα Συνοδινού και στον Πρόεδρο της Βουλής ο οποίος προσπαθούσε να την ηρεμήσει. Ο Αθανάσιος Τσαλδάρης ζήτησε να βγεί εκτός αιθούσης η Αννα Συνοδινού και μάλιστα κάλεσε και τον φρούραρχο αλλά τότε εκείνη του απάντησε: «Φεύγω και μόνη μου» και αποχώρησε.